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郭可信先生是我國著名的電子顯微學(xué)和晶體學(xué)家,在國內(nèi)率先引入高分辨電子顯微鏡,開始從原子尺度直接觀察晶體結(jié)構(gòu)的研究。郭可信先生為我國的金屬材料物理研究以及電子顯微學(xué)研究事業(yè)培養(yǎng)了大量的人才,桃李滿天下。為繼承郭可信先生的遺志,為中國電子顯微學(xué)的持續(xù)發(fā)展做貢獻(xiàn),2008年由郭可信先生的學(xué)生倡導(dǎo)發(fā)起,國內(nèi)外從事電鏡研究應(yīng)用的華人學(xué)者經(jīng)過認(rèn)真商討,決定每年舉辦一次郭可信電子顯微學(xué)和晶體學(xué)暑期學(xué)校,并以材料科學(xué)和生物學(xué)應(yīng)用為主題輪流舉行。
2014年7月26日-27日,“第七屆郭可信電子顯微學(xué)和晶體學(xué)暑期學(xué)校”在中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生化與細(xì)胞所國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心•上海(籌)舉辦。本期暑期學(xué)校為“2014冷凍電鏡(cryo-EM)三維分子成像國際研討會”的一個組成部分,著眼于冷凍電鏡相關(guān)實(shí)驗(yàn)技術(shù)及計(jì)算軟件的實(shí)踐技術(shù)培訓(xùn),旨在培養(yǎng)我國生物冷凍電鏡高技術(shù)人才及年輕后備人才。
根據(jù)冷凍電鏡的技術(shù)特點(diǎn),本期暑期學(xué)校分為了電鏡操作技術(shù)培訓(xùn)和圖像處理技術(shù)培訓(xùn)兩個部分。邀請了來自海外的知名專家學(xué)者進(jìn)行講授培訓(xùn)。
電鏡操作技術(shù)培訓(xùn)
冷凍電鏡技術(shù)作為結(jié)構(gòu)生物學(xué)及細(xì)胞生物學(xué)的新興研究方法,在過去十幾年里技術(shù)上取得了長足的發(fā)展,最近幾年在國內(nèi)也得以推廣并取得極大進(jìn)步,越來越多的研究小組關(guān)注這一技術(shù)的應(yīng)用。
加州大學(xué)舊金山分校 程亦凡博士
來自加州大學(xué)舊金山分校的程亦凡博士介紹了冷凍電鏡的基本原理、儀器構(gòu)造、生物樣品制備、三維重構(gòu)的原理、以及電子晶體學(xué)、單顆粒三維重構(gòu)、電子斷層三維重構(gòu)技術(shù)的特點(diǎn)與應(yīng)用等內(nèi)容。
布蘭迪斯大學(xué) 徐晨博士
布蘭迪斯大學(xué)的徐晨博士從冷凍電鏡設(shè)施的建立、冷凍電鏡樣品的制備和操作,以及當(dāng)前電鏡操作的自動化、遠(yuǎn)程控制等先進(jìn)技術(shù)。最后,徐晨還介紹了新型圖像探測器—直接電子探測器的市場和應(yīng)用情況。
匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院 Peijun Zhang博士
匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Peijun Zhang博士介紹了共聚焦顯微鏡與冷凍電鏡結(jié)合使用在活細(xì)胞檢測方面的應(yīng)用。
美國斯克利普斯研究所 Anchi Cheng博士
來自美國斯克利普斯研究所的Anchi Cheng博士介紹了其參與研發(fā)的Leginon電鏡數(shù)據(jù)自動收集的軟件與方法。Leginon是目前應(yīng)用比較成熟的單顆粒自動化數(shù)據(jù)收集軟件之一。
霍華德•休斯醫(yī)學(xué)研究所 Dan Shi博士
此外,還有來自霍華德•休斯醫(yī)學(xué)研究所的Dan Shi博士介紹了電子衍射數(shù)據(jù)收集的相關(guān)內(nèi)容。
圖像處理技術(shù)培訓(xùn)
雖然近年來冷凍電鏡技術(shù)進(jìn)入快速發(fā)展期,然而與其配套的圖像處理及三維重構(gòu)技術(shù)在國內(nèi)發(fā)展還相對滯后,一定程度上制約了該技術(shù)在我國的應(yīng)用。此次培訓(xùn)班專門開設(shè)了電鏡數(shù)據(jù)圖像處理及三維重構(gòu)技術(shù)課程,幫助學(xué)員系統(tǒng)全面地掌握最新的冷凍電鏡圖像處理技術(shù)和軟件。
美國Baylor醫(yī)學(xué)院 Steven Ludtke博士
EMAN2的開發(fā)者——美國Baylor醫(yī)學(xué)院的Steven Ludtke博士介紹了單顆粒冷凍電鏡三維重構(gòu)軟件EMAN2。1999年,Steven Ludtke博士等人推出了EMAN軟件的第一個版本,如今EMAN已成為世界上使用最廣泛、用于高分辨率單顆粒重構(gòu)的軟件之一。
英國劍橋MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室 Sjors Scheres博士
英國劍橋MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Sjors Scheres博士介紹了RELION軟件包,以及最大概然統(tǒng)計(jì)分析理論和貝葉斯理論在電鏡圖像分析和三維重構(gòu)中的應(yīng)用。在最近解析的高分辨率電鏡結(jié)構(gòu)中,很多應(yīng)用了RELION軟件包。
德國Jülich研究中心 Gunnar Schroder
德國Jülich研究中心的Gunnar Schroder博士介紹了DireX軟件包在電鏡三維密度圖限制下柔性建模、分析評估方法及其軟件的發(fā)展與應(yīng)用。
圖像處理技術(shù)培訓(xùn)現(xiàn)場
電鏡操作技術(shù)培訓(xùn)現(xiàn)場
在整個培訓(xùn)期間,除了邀請專家進(jìn)行授課培訓(xùn)外,還安排了充分的時(shí)間讓學(xué)員進(jìn)行實(shí)際操作培訓(xùn),并由授課老師直接進(jìn)行指導(dǎo)。接受培訓(xùn)的學(xué)生們表示通過此次培訓(xùn)對于冷凍電鏡及三維重構(gòu)技術(shù)有了更深入的了解和認(rèn)識,對于自己日后的研究工作頗有幫助。(撰稿:秦麗娟)
附錄:郭可信電子顯微學(xué)和晶體學(xué)暑期學(xué)校的由來
郭可信先生是我國著名的電子顯微學(xué)和晶體學(xué)家,在國內(nèi)率先引入高分辨電子顯微鏡,開始從原子尺度直接觀察晶體結(jié)構(gòu)的研究。郭可信先生與錢臨照、柯俊先生等科學(xué)家發(fā)起創(chuàng)建了中國電子顯微鏡學(xué)會,并親任理事長。同時(shí)郭先生在國際科學(xué)界具有重要影響,曾任亞太地區(qū)電子顯微學(xué)會聯(lián)合會主席等,并且郭可信先生為我國的金屬材料物理研究以及電子顯微學(xué)研究事業(yè)培養(yǎng)了大量的人才,桃李滿天下。
為繼承郭可信先生的遺志,為中國電子顯微學(xué)的持續(xù)發(fā)展做貢獻(xiàn),2008年由郭可信先生的學(xué)生倡導(dǎo)發(fā)起,國內(nèi)外從事電鏡研究應(yīng)用的華人學(xué)者經(jīng)過認(rèn)真商討,決定每年舉辦一次郭可信電子顯微學(xué)和晶體學(xué)暑期學(xué)校,并以材料科學(xué)和生物學(xué)應(yīng)用為主題輪流舉行。每年的暑期學(xué)校都電鏡學(xué)習(xí)培訓(xùn)班和學(xué)術(shù)研討會相結(jié)合的形式,一方面培養(yǎng)大家的電鏡基礎(chǔ)知識和操作技術(shù),另一方面能夠更好的了解國內(nèi)外電鏡應(yīng)用的最新研究進(jìn)展。
首屆郭可信電子顯微學(xué)和晶體學(xué)暑期學(xué)校在清華大學(xué)舉行,并舉辦“冷凍電鏡三維分子成像國際研討會”。此后,為了有系統(tǒng)持續(xù)性地推動冷凍電鏡研究領(lǐng)域的交流與發(fā)展,加強(qiáng)我國科研的國際交流合作,使青年學(xué)者有機(jī)會與該領(lǐng)域權(quán)威科學(xué)家面對面交流,并得到高層次的培訓(xùn),在中國每兩年舉辦一次生物領(lǐng)域的“郭可信電子顯微學(xué)與晶體學(xué)暑期學(xué)校”及“冷凍電鏡三維分子成像國際研討會”,第二屆會議2010年在中科院生物物理所舉辦;第三屆會議2012年在中國科技大學(xué)舉辦。
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